La carrera de Biología Marina de la UCSC se distingue por un sello ecológico al favorecer la formación de los estudiantes en la búsqueda del conocimiento a través de la aplicación del método científico para realizar investigación científica básica y aplicada, con el objetivo de resolver problemas relacionados con los organismos marinos y abordar situaciones, ya sea en sistemas naturales o intervenidos por la acción humana, incluyendo los recursos marinos y su uso sustentable. Para la materialización de este sello, en la formación se enfatiza el trabajo práctico en terreno y laboratorio con un componente metodológico y de diseño experimental orientado a proponer alternativas de acción respetuosas con el medio ambiente. Este sello se fundamenta en la experiencia de los académicos, la historia de la carrera y de la Facultad que la imparte, que antecede a la creación de la misma Universidad, y en la trayectoria de los egresados. La carrera es impartida principalmente por académicos del Departamento de Ecología y sus cursos biológicos y profesionales privilegian una perspectiva ecológica y ambiental. Este sello de la carrera en la UCSC es coherente con los principios institucionales y con la misión de la Facultad de Ciencias.